حضرت امام خمینی (ره) در واکنش به شهادت «سید مصطفی خمینی» فرمودند: خداوند تبارک و تعالی الطافی دارد ظاهر و الطافی خفیه. یک الطاف خفیه‌ای خدای تبارک تعالی دارد که ما‌ها علم به آن نداریم از این جهت صبر نمی‌کنیم این برای نقصان معرفت ماست. اگر اطلاع بر آن مسائل داشتیم در این‌طور مسائل جزیی این‌قدر بی‌طاقت نبودیم.

آیت الله قاضی به اتهام به زبان آوردن نام امام خمینی (ره) در یک سخنرانی با موضوع حکومت اسلامی و جنایات اسرائیل و تمجید از مقام امام راحل به مدت شش ماه به منطقه بافت کرمان تبعید و سپس شش ماه دیگر به زنجان تبعید شد.